手机浏览器扫描二维码访问
通路分析是利用全基因组中单个SNP与复杂疾病关联程度计算出对应基因与疾病的关联性,将全基因组基因注释到生物学通路中后,采用不同的数学模型计算每条通路与疾病关联性。中国科学院昆明动物研究团队等利用遗传关联信息网(GeneticAssociationInformationNetwork,GAIN)的精神分裂症GWAS数据进行通路分析,发现谷氨酸代谢通路、转化生长因子-β(transforminggrowthfactorβ,TGF-β)信号通路、肿瘤坏死因子受体通路、雌雄激素代谢通路。
随着全基因组研究的深入和数据积累,目前利用GWAS数据检验不同疾病之间的遗传机制的共性成为常见的研究手段,主要可以分为SNP水平和多位点水平。在SNP水平,主要通过寻找与多个疾病或性状显著关联的SNP。中国科学院和云南省动物模型与人类疾病机理重点实验室利用欧洲多个样本的精神分裂症GWAS数据进行Meta分析,发现
SLC39A8
基因上多个风险SNP,进一步研究发现风险SNPrs13107325与多种疾病和性状显著关联,如高血压、肥胖、体重指数(bodymassindex,BMI)、能量摄取等。在多位点水平,在全基因组水平选取一组与疾病或性状相关的风险SNP,从而计算疾病或性状之间的遗传关联,目前常用的方法有连锁不平衡系数回归(LDscoreregression)、多基因遗传风险分析(polygenicriskscore,PRS)。Hill等利用连锁不平衡系数回归方法,对精神障碍、儿童和老年认知、受教育程度的GWAS数据进行分析,结果发现精神分裂症与老年认知存在着遗传关联(rg=-0.231,
P
=3.81e-12),而与儿童时期认知(rg=-0.044,
P
=0.443)、受教育程度(rg=0.06,
P
=0.093)并无遗传关联。该结果提示,对年龄相关的认知功能衰退具有保护作用的遗传变异与精神分裂症存在显著地遗传关联,也为达尔文学说负性选择(negativeselection)没有筛选掉精神分裂症风险SNP提供了线索。
拷贝数变异(CNV)研究也是近年来基因组学研究热点,22q11.21是目前最为熟知的精神分裂症相关拷贝数变异,它代表22号染色体长臂上1.5~3Mb缺失,22q11.21缺失在精神分裂症患者的患病率为0.3%,该区域基因大多数在脑中表达,其中儿茶酚氧位甲基转移酶(
COMT
)、脯氨酸脱氢酶(
PRODH
)、锌指蛋白(zincfingerDHHC-typecontaining8,
ZDHHC8
)和
DGCR8
基因功能受损或者缺失,会造成分子细胞功能改变,神经环路损害,神经系统变化,最终会造成行为和认知功能的异常。
DNA甲基化是表观遗传学修饰的主要机制之一,近年来许多研究者根据表观遗传修饰假说研究精神分裂症的甲基化修饰情况。2016年,Jaffe等选取335名正常对照和191例精神分裂症患者尸脑的前额叶皮层组织进行全基因组甲基化研究,结果发现精神分裂症GWAS发现的风险SNP中,大约有14会影响大脑发育时期的甲基化修饰程度。研究表明,表观调控机制尤其是甲基化修饰在精神分裂症发病机制中起到重要作用。
(二)抑郁症的遗传学研究进展
抑郁症又称抑郁障碍,是心境障碍的主要类型,临床上主要表现为情绪低落、思维迟缓、意志活动减退、认知功能损害等。抑郁症所致疾病负担沉重,占全球疾病伤残调整生命年(disability-adjustedlifeyear,DALYs)的42.5%,是导致非致命性疾病残疾的主要原因。
Kohli等采用GWAS发现脑源性神经营养因子(
BDNF
)基因rs1545843多态性位点在欧洲和非裔美国人群样本中均与抑郁症显著关联,且风险等位基因A携带者脑内海马体积显著下降。2015年中国牛津弗吉尼亚州立大学遗传流行病学实验研究(China,OxfordandVirginiaCommonwealthUniversityExperimentalResearchonGeneticEpidemiology,CONVERGE)发表了一项重型抑郁症的研究中,研究者通过对环境因素的筛查严格控制了临床表型的异质性,发现去乙酰化酶(sirtuin1,SIRT1)及无机焦磷酸化酶无机焦磷酸酶(phospholysinephosphohistidineinorganicpyrophosphatephosphatase,LHPP)多态性与重型抑郁症关联,并得到初步重复。SIRT1参与编码去乙酰化酶(sirtuins),主要功能包括促进轴突伸长、神经突发生和树突分支、调控突触可塑性、参与记忆形成等。连锁分析发现
LHPP
与5-羟色胺1A受体(
HTR1A
)基因的交互作用与抑郁症关联。该研究也进一步验证了之前Neff等利用连锁分析策略和测序技术在犹他人群中发现
LHPP
多态性位点与抑郁症关联的结论。
2015年人格遗传联盟(GeneticsofPersonalityConsortium)对27个队列63000名被试进行人格维度GWAS分析,发现膜相关鸟苷酸反转激酶1(membrane-associatedguanylatekinase1,
MAGI1
)基因存在一个GWAS水平显著关联位点,该基因曾被报道与双相情感障碍和精神分裂症关联;进一步采用多基因风险评分(PRS)方法,在独立GWAS样本中验证,发现神经质相关的风险基因型可以显著地预测重度抑郁。
至今文献重复性相对较好的抑郁症易感基因有:色氨酸羟化酶-2(tryptophanhydroxylase2,
TPH2
)、5羟色胺转运体(solutecarrierfamily6,member4,
SLC6A4
)、
COMT
团体心理咨询与治疗 位面三国争霸 明代社会生活史 平凡不平凡的世界 中国皇帝全传 曾国藩全书 全球进入异世界 中年了不能玩游戏吗 太平里的广记 李俊峰 实用小儿学(第3版) 穿成女配决心好好当团宠 刘寅传 财智在线,萧爷总是夸夸妻谈 神级龙珠系统 空军武器大百科 拿破仑传(全新升级版) 诗经全集 覆雪归春 全面崛起
天赋榜财富榜强者榜穿越到这个任何事物都要用榜单来评个高低的奇怪世界,王野有点慌激活了无限打榜系统,王野有点小开心超越榜单名次可以获得无限奖励,王野更开心了若干年后,看着宇宙间所有榜单上唯有绝色佳人榜没有自己的名字,王野终于做出了一个违背祖宗的决定...
太上老君座下典籍童子被陷害进入人间,附体在一个穷挫大学生余仁亮的身上。更要命的是余仁亮刚刚导致饭店厨房火灾被老板炒了鱿鱼。众人鄙视的目光,所有人肆无忌惮的调侃,面对这个陌生而又危机四伏的世界,他不得不重新开始漫漫修行路,不得不重新踏上成为强者的路途。。。。。。读者群118931859,进群先冒泡哦...
一场穿越,废材小姐惊艳重生。神奇的玉珏开启,附赠冰山男神一枚。丹药神器魔兽灵宠应有尽有修行炼丹虐渣所向披靡开挂的人生不要太美好。欠我的统统给我还回来!废材逆袭,逆天改命。她强悍的前行,她的命运,只能由她掌控!不服?打赢她身边的冰块男神再说!...
前世,叶微甜识人不清,错把白莲花当闺蜜,最后落的一个惨死下场,再次重生,叶微甜重生到了资金短缺,物资匮乏的八零年代,极品哥姐,护短爹娘,一重生就这么刺激?叶微甜卷起袖子准备开虐,只是那个身份神秘的傲娇老公是从哪里蹦出来的?时景琛表示,渡劫失败,从天上掉下来的!...
...
巅峰聚焦品牌佳作,强力推荐少年龙傲,十年沉寂,从天才沦落为废物,受尽奚落和嘲讽。十年坚持,万次失败,终获神秘龙印。以荒芜圣体,修炼无敌功法,炼化天地万物,吞噬无尽星辰,横扫荒宇,睥睨苍穹!问苍茫星宇,何人敢与我一战?浩瀚星空,吾惟战神!龙宗群217135300...